(1)水泥池微贮法　 将农作物秸秆铡短切碎，按比例喷洒菌液后装入池内，分层压实、封口。这种方法的优点是池内不易进气进水，密封性好，经久耐用。
　　(2)土窖微贮法选　 择地势高、土质硬、向阳干燥、排水容易、地下水位低、离畜舍近、取用方便的地方，根据贮量挖一个2-3米深的长方形窖，在窖的底部和周围铺一层塑料薄膜，将秸秆放入池内，分层喷洒菌液压实，上面盖上塑料薄膜后覆土密封。这种方法的优点是贮量大，成本低，方法简单。
　　(3)塑料袋窖内微贮法　 此法首先是按土窖微贮法选好地点，挖一圆形窖，将装满秸秆的塑料袋放入窖内，分层喷洒菌液，压实后将塑料袋口扎紧覆土。这种方法是不易漏气进水，适于处理100--200千克秸秆。
　　(4)大型窖微贮法　 奶牛场大型窖可采用机械作业方式，提高生产效率，压实机械可使用轮式拖拉机或履带式拖拉机。喷洒菌液用的潜水泵规格选用扬程20-30米，流量每分钟3-50升为宜。
　　配制菌用的水箱可以用牛场饮水的水箱，水箱容积在0．5-2立方米之间为好，最好有两个水箱交替使用。喷头可自制，用一段40-50厘米长的铁管，将铁管的一端用锤打成鸭嘴状，另一端套在橡胶水管上即可使用。这种方法适用于大型奶牛场及育肥场，一次可处理秸秆50吨以上。此方法具有省工、省时、效率高等特点。