1.掺杂掺假问题
　　鱼粉中蛋白质含量很丰富，优质鱼粉的蛋白质含量高达60％～65％；而国产鱼粉因原料质量较差，一般蛋白质含量仅为40％左右；但优质的国产鱼粉其蛋白质含量也可达到50％；相反，劣质鱼粉的蛋白质含量仅为20％左右，且常有掺假现象，品质不良。由于鱼粉价格较贵，鱼粉掺杂问题严重。掺杂物种类繁多，如尿素、糠麸、饼粕、血粉、羽毛渣、锯末、花生壳、砂砾等，在购货时必须进行检测。
　　2.食盐含量问题
　　鱼粉中的食盐含量不能过高。日本对出口鱼粉定为含盐量3%以下，美国规定3%-7%。我国鱼粉生产工艺较落后，缺乏鲜鱼脱水和保存设施，常用食盐盐渍办法保存，致使食盐含量过高，有的甚至高达30%，这类鱼粉不能用作饲料。日粮中食盐过高，会导致食盐中毒，鸡最敏感。因此，在使用高盐鱼粉时，要先测盐分含量，再确定鱼粉的添加量。
　　3.发霉变质问题
　　鱼粉是微生物繁殖的良好底物，在高温高湿条件下，极易发霉、沙门氏菌和大肠杆菌感染，甚至出现自燃现象。因此，鱼粉的充分干燥是防止发霉变质的关键。
　　4.氧化酸败问题
　　脂肪含量多的鱼粉以及鱼粉贮存不当时，其中所含的不饱和脂肪酸极易氧化生成醛、酸、酮等物质，使鱼粉变质发臭，适口性和品质显著降低。因此，鱼粉中的脂肪含量不宜过多，此外，为防止鱼粉氧化酸败，贮存时应存放于干燥避光处，并添加抗氧化剂。