饲料中的虫害、螨害与鼠害 ①虫害：饲料在储藏过程中常受到虫害的侵蚀，造成营养成分的损失或毒素的产生。②螨害：在温度适宜，湿度较大的地区螨类对饲料的危害较大。③鼠害：鼠的危害不仅在于它们吃掉大量的饲料，而且它们还会造成饲料污染，引发疾病传播。
　　饲料中的微生物污染 ①霉菌：能导致人畜中毒的霉菌主要有黄曲霉菌、青霉菌和镰刀霉菌等。②霉菌毒素：较常见的霉菌毒素有黄曲霉毒素、玉米赤毒素、玉米赤霉烯酮和单端孢霉菌毒素，其中黄曲霉毒素的毒性最强。
　　饲料中的抗营养因子 饲料中的抗营养因子主要有：蛋白酶抑制因子、碳水化合物抑制因子、矿物元素生物有效性抑制因子、拮抗维生素作用因子、刺激动物免疫系统作用因子等。它们的存在干扰了饲料中养分的消化，吸收和利用。
　　饲料中的有毒有害化学物质该物质 主要由以下3类污染所造成。①农药污染。②工业“三废”的污染。③营养性矿物质添加剂带来的污染。
　　饲料中非营养性添加剂带来的污染 抗生素、激素、抗氧化剂、防霉剂和镇静剂的使用对预防疾病，提高饲料利用率和生长速度起着巨大的作用，但若不严格遵守使用原则和控制使用对象，安全用量及停药时间，就会使药物及其代谢产物在肉、蛋、奶中残留并通过畜禽排泄物污染环境。
　　饲料加工过程产生的毒物及交叉污染 工艺条件控制不当，饲料中成分复杂的添加剂在粉碎，输送，混合，制粒，膨化等特殊的加工过程中会发生降解反应，氧化———还原反应会生成一些复杂的化合物，这一方面降低了饲料中有效成分的效价，另一方面又产生了新的有害物质。此外，饲料生产过程中的混杂污染也是影响饲料卫生质量的一个重要因素。故在饲料加工过程中尤其是在饲料加药生产过程中要注意设备的清扫，避免药物在输送及混合过程中的分级和残留。