新洁尔灭消毒法   可用5%的新洁尔灭原液，加水配制成0.1%的溶液，用喷雾器喷洒在种蛋表面即可。
漂白粉液消毒法   将种蛋浸入含有活性氯1.5%的漂白粉液中3分钟，取出沥干后即可装箱。使用此法，必须在通风处进行。
        碘液消毒法   将种蛋置于0.1%的碘液中浸泡30～60秒，取出沥干后装盘。碘溶液的配制方法：碘片10克，碘化钾15克，二者同溶于1000毫升清水中，然后再倒入9000毫升清水中即可。浸泡种蛋10次后，溶液中的碘浓度会降低，如需再用，则可延长浸泡时间至90秒，或者添加新配制的溶液。
        福尔马林（甲醛溶液）消毒法   用福尔马林与高锰酸钾混合熏蒸消毒种蛋和孵化机。每立方米用5克高锰酸钾和30毫升福尔马林。这种熏蒸消毒法，可以同时消毒种蛋和孵化机。