秋季，各种病原体繁殖迅速,饲料易霉变,饲养家兔若管理不善,极易发生肠炎。兔肠炎有多种类型，生产实践中应根据不同病因，对症治疗。
　　寄生虫性肠炎　主要由各种球虫引起，当年出生的幼兔最易感染，可采取推迟幼兔断奶时间、加喂高效抗球虫药等措施来预防。
　　细菌性肠炎　主要由大肠杆菌、魏氏梭菌、巴氏杆菌等病菌引起。由大肠杆菌引起的病例，要注意合理配制饲料，饲料中粗纤维的比例要适宜，严禁饲喂发霉变质的饲料，用来拌饲料和饮用的水要清洁无污染，水分多的青绿饲料要稍微晒一下再饲喂；由魏氏梭菌引起的病例，应做好仔兔断奶初期的换料工作，注意加喂一些含蛋白质高的干草，以调节病兔的肠胃功能；由巴氏杆菌引起的病例，除做好兔舍通风换气外，最有效的预防办法是建立无特定病原体的兔群。
　　中毒性肠炎　长期饲喂发霉饲料会引起兔全身性中毒，并拉稀不止，剖检可发现病兔各脏器充血溃烂。由于毒素侵袭时间长，中毒性肠炎一般很难治愈，从养殖效益角度考虑，这类病兔没有治疗价值，但应注意将中毒性肠炎与巴氏杆菌、魏氏梭菌引起的肠炎相区别，三者的共同特征是兔的外阴部溃烂、招蝇，不同的是后两者引起的肠炎分别以鼻炎和腹泻为特征。
　　应激性肠炎　秋季室内外温差大，兔极易发生应激性肠炎，应加强室内空气流通，适当降低饲养密度，创造一个良好的温度环境。