一、必须购买优质藻种在购买时，通过藻液的外观和显微镜检查，选取生长旺盛，没有微生物、敌害生物和杂藻污染的藻液。

　　二、培养中尽量避免藻种污染问题

　　１.保种室　污染源主要为细菌，所以我们应注意消毒以保证种瓶中的藻类良好生长。坚持每日地面消毒；每次摇瓶、接种前都要用肥皂把手洗干净，再用酒精消毒，以免手上细菌污染藻种；接种用的三角烧瓶、细口瓶也要彻底消毒；盖瓶口的白纸也必须保证干净，定期更换；非工作人员不得进入保种室，以免带入细菌等。

　　若种瓶中已污染细菌，则细菌的大量繁殖会导致藻细胞生长缓慢，大量下沉，可在１升藻液中加入１万国际单位青霉素，有效抑制细菌的生长。

　　2.车间内　污染源主要为细菌、轮虫、小型原生动物，所以我们应注意：⑴刷池一定要彻底，彻底清除池中存有的污染源；⑵操作一定要规范，避免池间交叉感染及人为的带入污染源。若池中敌害生物已影响到藻类的生长，可采取措施如下：⑴使用过滤方法清除大型敌害生物（如轮虫等），可用网孔60um的密筛绢过滤，连续过滤3天，每天一次；⑵10ppm～15ppm有效氯杀球藻中小白虫；⑶0.03%的医用浓氨水，可有效杀灭扁藻和金藻中尖鼻虫；⑷盐藻中有变形虫危害时，可利用盐藻嗜盐的特点，在藻液中加入适量食盐，可杀死变形虫或其他小型原生动物，被污染的培养液也会由黄绿色变为鲜绿色，生长旺盛；⑸扁藻、金藻中出现尖鼻虫、游仆虫，可用盐酸酸化的方法杀灭，在藻液中加入1摩尔盐酸(即纯盐酸与水以1∶11的比例混合），边加边搅拌，当藻液pH值降到3，停止加盐酸，酸化1小时，然后用1摩尔氢氧化钠中和至原pH值范围，第二天，藻液便可恢复游动，经过一段时间培养，藻液生长正常。