1、疾病的种类增多，死亡率高。
引起家禽死亡的原因很多，据不完全统计，目前，对我国养禽业构成威胁和造成危害的疾病已达80多种，涉及传染病、寄生虫病、营养代谢病和中毒性疾病等，其中以传染病为最多，约占禽病总数的75%以上。同时，不仅疾病的种类增多，而且发病的种类也逐渐增多，除常见的鸡、鸭、鹅外，鸽、孔雀、鹌鹑、鸵鸟、七彩山鸡，珍珠鸡等及观赏鸟都有发病的报导。由于疫病的发生及管理不善，我国蛋鸡产蛋期死亡淘汰率高达20%~25%，而发达国家不足5%。据估计，我国每年因各类禽病导致家禽的死亡率高达15%~25%，经济损失数百亿元。
2、新发生的禽病种类增多。
近年来，随着动物及其产品贸易的全球化和我国养禽业超常发展，给我国养禽业带来诸多问题，这就是旧病未除，又添新病。影响较大有鸡传染性贫血、禽流感，肾型和腺胃型传染性支气管炎、鸡病毒性关节炎、禽网状内皮组织增殖症、包涵体肝炎、产蛋减少综合症、雏鸭病毒性肝炎、番鸭细小病毒病，鸭疫里默氏杆菌病，鸭新城疫、鸭法氏囊病、鹅副粘病毒病、雏鹅新型病毒性肠炎、鹅红眼病、禽白血病J亚群、禽衣原体病、肉鸡腹水综合症和隐孢子虫病等。
3、病原体出现变异，临床症状非典型化。
在禽病的发生和流行过程中，由于一些禽病的病原体出现了变异，导致临床症状非典型化。马立克氏病毒(MDV)，1960年以前为中毒型，1960~1980年为强毒型(vMDV)，70年代后期至80年代初期为超强毒型(vvMDV)，80年代后期呈超超强毒型(vv＋MDV)。传染性法氏囊病病毒(IBDV)，70年代后期至80年代，强毒型(vIBDV)，90年代，超强毒型(vvIBDV)。新城疫病毒(NDV)，30年代至90年代初期，中发型和速发型，90年代中后期，速发型。
传染性支气管炎ID，80年代以前，，呼吸型，80年代至今，肾型，90年代至今，肾型、腺胃型、脑肌型。IBD，80年代以前， 主要发生于2—15周龄的鸡，4—6周龄鸡最易感。90年代至今，早可提前到3日龄—4日龄，晚可推迟到25周龄。ND，90年代以前，鸭、鹅不发病，90年代中期以后，鸡、鸭、鹅均发病，且可相互传播。产蛋减少综合征（EDS）：90年代以前，鸭带毒不发病，鹌鹑不发病，90年代中后期，鸭、鹌鹑均发病。禽流感（AIV），2000年以前，鸭、鹅带毒不发病，2000年以后，鸡、鸭、鹅均发病并相互传播。
4、某些细菌性疾病和寄生虫病的危害加大。
随着集约化养禽场的增多和规模的不断扩大，污染越趋加重，近年来，细菌性疾病和寄生虫病明显增多， 由此所造成的危害也在加大。如鸡的大肠杆菌病、沙门氏菌病、葡萄球菌病、绿脓杆菌病、支原体病、鸡球虫病等等，这些病原广泛存在于养禽环境中，可通过多种途径传播，成为养禽场的常在菌和常发病，导致发病率和死亡率上升，鸡肉品质下降，经济效益下降，甚至有的病原体还可通过禽肉产品传染给人类，危害人体健康。
另外，家禽的某些损害免疫系统的疾病，如传染性法氏囊病，鸡传染性贫血、网状内皮组织增殖症、马里克氏病、淋巴白血病等免疫抑制病的存在，使得家禽免疫功能及抵抗能力下降，也很容易造成细菌性疾病的发生。更令人担忧的是滥用抗生素和饲料中长期添加抗生素添加剂，导致细菌的耐药性越来越普遍，控制细菌疾病已成为一大难题。
5、多病原混合感染和综合症使疾病更为复杂。
在实际生产中常见很多病例是由两种或两种以上的病原对同一鸡体致病，并发和继发感染。这些多病原的混合感染给诊断和防治工作带来了难度，由于并因的不清，症状不明，加之诊断手段跟不上，往往造成诊断不准确，死亡率极高的原因。