首先，要明确除草剂品种和使用的时期，如在小麦收获后机播玉米，在玉米和杂草出苗前使用的除草剂，称为土壤处理剂，可用乙阿合剂、青岛闲农苞米棒等，使用后可以保持一定时期的封闭作用，在杂草出苗时将其杀死。如果墒情较好，也可以不浇地；但是如果天气比较干旱少雨，土壤墒情较差，则既不利于玉米发芽，也不利于杂草集体出土，会严重影响土壤处理剂药效的发挥，降低除草效果。如果错过土壤处理的用药时期，或者是麦茬套种玉米，玉米已经出苗，则不能再使用土壤处理剂，否则会产生药害。在玉米3—6叶，杂草2—4叶时，可以使用玉农乐等进行叶片喷洒，称为茎叶处理剂。另外，如果麦套玉米播种较晚，杂草和玉米都没有出苗时，由于麦茬和麦糠的存在，一般土壤处理剂会被其阻隔，除草效果不理想。而青岛闲农生产的苞米棒添加特殊助剂，可以穿透这些物理因素的影响，取得较好的除草效果。最后，如果某些杂草控制不好，点片发生严重，在玉米6叶以上，可以在喷头加保护罩，如果没有也可以使用可乐瓶等饮料瓶的瓶颈，在无风、晴朗的天气定向喷施克芜踪的方法进行补救。有风时药剂雾滴会飘移，对玉米产生药害；晴朗天气有利于药剂吸收，发挥药效。
其次，我们应该严格按照除草剂标签和说明使用，不能任意扩大使用范围和增加、减少剂量，否则也可能会产生药害，或者对下茬作物产生药害。例如阿特拉津等土壤残留时间较长的除草剂，大剂量使用后会对小麦等后茬作物产生严重药害。
天气和土壤情况对使用除草剂也有重要影响。玉农乐等茎叶处理剂要避免雨前喷施，间隔时间视不同的除草剂而不同，但一般为6个小时以上，否则雨水对除草剂的冲刷会影响药效。沙土地要降低除草剂用量，否则易产生药害，粘土要增加剂量，否则除草剂效果会降低。
除草剂不是万能药，例如常用的乙草胺对马齿苋、反枝苋等阔叶杂草，阿特拉津对狗尾草、稗草等单子叶杂草的效果就不理想。